恐惧症的诊断主要依据患者的主要临床特点。患者对某些客体或处境有强烈恐惧，恐惧的程度与实际危险不相称；发作时有焦虑和自主神经症状；有反复或持续的回避行为；知道恐惧过分、不合理，或不必要，但无法控制。对恐惧情景和事物的回避必须是或曾经是突出症状。病程持续3个月。依据上述的诊断要点可以做出恐惧症的诊断。然后根据患者的临床表现特征，即所害怕的场景、社交场合和人际交往或特定的对象来分别进行恐惧症亚型的诊断。

精神分裂症在幻觉或被害妄想的影响下可以出现类似恐惧症的恐惧症状表现。但多同时有精神病性症状，而在客观环境中不具备明确的恐惧对象。

广泛性焦虑障碍主要表现为没有客观对象的紧张、害怕，担心的事情变化不定，且回避行为不明显，而恐惧症害怕的对象明确，且回避行为明显。

颞叶癫痫可表现为阵发性恐惧，但其恐惧并无具体对象，发作时的意识障碍、脑电图改变及神经系统体征可资鉴别。